Biopython - 测试技术

Biopython 有丰富的测试脚本,可以在不同的条件下测试软件,以确保软件没有错误。 要运行测试脚本,请下载 Biopython 的源代码,然后运行以下命令 −

python run_tests.py

这将运行所有测试脚本并提供以下输出 −

Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] 
Operating system: posix darwin 
test_Ace ... ok 
test_Affy ... ok 
test_AlignIO ... ok 
test_AlignIO_ClustalIO ... ok 
test_AlignIO_EmbossIO ... ok 
test_AlignIO_FastaIO ... ok 
test_AlignIO_MauveIO ... ok 
test_AlignIO_PhylipIO ... ok 
test_AlignIO_convert ... ok 
........................................... 
...........................................

我们也可以按照下面的说明运行单独的测试脚本 −

python test_AlignIO.py

结论

据我们了解,Biopython 是生物信息学领域的重要软件之一。 用python编写(易学易写),提供了丰富的功能来处理生物信息学领域的任何计算和操作。 它还为几乎所有流行的生物信息学软件提供了简单灵活的接口,以充分利用其功能。